این سری برداشتی از Neon Genesis Evangelion است که در آن تمام بازیگران سری اصلی حالا دانش‌آموزان عادی هستند و با هم در مدرسه راهنمایی در توکیو-3 تحصیل می‌کنند. سه خواهر Rei در این سری حضور دارند: یکی کودکی است که کمتر از بقیه است، دیگری بر اساس Rei 2 است و سومین Rei بر اساس Rei Alternate که در صحنه رویاهای حالت جایگزین در پایان سری اصلی دیده می‌شود. همچنین واحد Evangelion 01 هم یکی از هم‌کلاسی‌های آنهاست، این بار به صورت ربات انسانی که به نوعی زورگوی کلاسی است. حتی ربات Jet Alone هم به عنوان یک شخصیت در این سری بازآفرینی شده است.